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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Semiárido. Para informações adicionais entre em contato com cpatsa.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
27/03/2020 |
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Data da última atualização: |
15/03/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VIANA, T. F. C.; CAMPELO, A. P. S.; BALDANI, J. I.; FERNANDES JUNIOR, P. I.; BALDANI, V. L. D.; SILVA, W. M.; PAGGI, G. M; BRASIL, M. S. |
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Afiliação: |
UFMS; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; PAULO IVAN FERNANDES JUNIOR, CPATSA; VERA LUCIA DIVAN BALDANI, PESQUISADORA APOSENTADA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; UFMS; UFMS; UFMS. |
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Título: |
Cultivable bacterial diversity associated with bromeliad roots from ironstone outcrops in central Brazil. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Biology, v. 80 n. 4, oct./dec. 2020. |
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ISSN: |
1519-6984 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/1519-6984.224982 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em Português: Diversidade de bactérias cultiváveis associadas a raízes de bromélias de afloramentos ferruginosos do Brasil central. |
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Conteúdo: |
Studies on the bacterial diversity associated with wild plants are rare, especially on those that grow in association with bromeliads. In the present study, we isolated and identified epiphytic and endophytic bacteria from the roots of the bromeliads Dyckia excelsa, Dyckia leptostachya and Deuterocohnia meziana occurring in the ?cangas? in the Pantanal from Mato Grosso do Sul State, Brazil. The epiphytic bacteria were isolated from washed roots, while the endophytic bacteria were isolated from surface disinfested roots. Bacterial representatives corresponding to each BOX-PCR fingerprint, as well as those that did not result in amplicons, were selected for 16S rDNA gene sequence analysis. The BOX-PCR data showed intrageneric and intraspecific diversity and could discriminate strains and identify their phenotypic characteristics. The 16S rDNA gene sequence and phylogeny analysis showed a higher occurrence of strains belonging to the genus Bacillus than Mycobacterium and Brevibacterium, which were found in lower numbers. Species from the Bacillus genus are well known for their sporulation capacity and longer survival in arid locations, such as the ?cangas?. This study clearly showed that the bromeliad species represent a vast reservoir of bacterial community diversity, and the cultivable strains represent a new source for biotechnological prospecting. |
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Palavras-Chave: |
Diversidade bacteriana; Epiphytic. |
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Thesagro: |
Bactéria; Bromélia; Planta Silvestre. |
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Thesaurus Nal: |
Bacillus (bacteria); Bacillus endophyticus; Dyckia. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
LEADER 02503naa a2200337 a 4500
001 2121383
005 2021-03-15
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022 $a1519-6984
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520 $aStudies on the bacterial diversity associated with wild plants are rare, especially on those that grow in association with bromeliads. In the present study, we isolated and identified epiphytic and endophytic bacteria from the roots of the bromeliads Dyckia excelsa, Dyckia leptostachya and Deuterocohnia meziana occurring in the ?cangas? in the Pantanal from Mato Grosso do Sul State, Brazil. The epiphytic bacteria were isolated from washed roots, while the endophytic bacteria were isolated from surface disinfested roots. Bacterial representatives corresponding to each BOX-PCR fingerprint, as well as those that did not result in amplicons, were selected for 16S rDNA gene sequence analysis. The BOX-PCR data showed intrageneric and intraspecific diversity and could discriminate strains and identify their phenotypic characteristics. The 16S rDNA gene sequence and phylogeny analysis showed a higher occurrence of strains belonging to the genus Bacillus than Mycobacterium and Brevibacterium, which were found in lower numbers. Species from the Bacillus genus are well known for their sporulation capacity and longer survival in arid locations, such as the ?cangas?. This study clearly showed that the bromeliad species represent a vast reservoir of bacterial community diversity, and the cultivable strains represent a new source for biotechnological prospecting.
650 $aBacillus (bacteria)
650 $aBacillus endophyticus
650 $aDyckia
650 $aBactéria
650 $aBromélia
650 $aPlanta Silvestre
653 $aDiversidade bacteriana
653 $aEpiphytic
700 1 $aCAMPELO, A. P. S.
700 1 $aBALDANI, J. I.
700 1 $aFERNANDES JUNIOR, P. I.
700 1 $aBALDANI, V. L. D.
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700 1 $aPAGGI, G. M
700 1 $aBRASIL, M. S.
773 $tBrazilian Journal of Biology$gv. 80 n. 4, oct./dec. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
09/08/2019 |
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Data da última atualização: |
02/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
CAMARGO, A. P.; SOUZA, R. S. C. de; COSTA, P. de B.; GERHARDT, I. R.; DANTE, R. A.; TEODORO, G. S.; ABRAHÃO, A.; LAMBERS, H.; CARAZZOLLE, M. F.; HUNTEMANN, M.; CLUM, A.; FOSTER, B.; FOSTER, B.; ROUX, S.; PALANIAPPAN, K.; VARGHESE, N.; MUKHERJEE, S.; REDDY, T. B. K.; DAUM, C.; COPELAND, A.; CHENM U, M. A.; IVANOVA, N. N.; KYRPIDES, N. C.; PENNACCHIO, C.; ELOE-FADROSH, E. A.; ARRUDA, P.; OLIVEIRA, R. S. |
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Afiliação: |
ANTONIO PEDRO CAMARGO, Unicamp; RAFAEL SOARES CORREA DE SOUZA, Unicamp; PATRÍCIA DE BRITTO COSTA, Unicamp, University of Western Australia; ISABEL RODRIGUES GERHARDT, CNPTIA, Unicamp; RICARDO AUGUSTO DANTE, CNPTIA, Unicamp; GRAZIELLE SALES TEODORO, UFPA; ANNA ABRAHÃO, Unicamp, University of Western Australia; HANS LAMBERS, University of Western Australia; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, Unicamp; MARCEL HUNTEMANN, Department of Energy Joint Genome Institute; ALICIA CLUM, Department of Energy Joint Genome Institute; BRIAN FOSTER, Department of Energy Joint Genome Institute; BRYCE FOSTER, Department of Energy Joint Genome Institute; SIMON ROUX, Department of Energy Joint Genome Institute; KRISHNAVENI PALANIAPPAN, Department of Energy Joint Genome Institute; NEHA VARGHESE, Department of Energy Joint Genome Institute; SUPRATIM MUKHERJEE, Department of Energy Joint Genome Institute; T. B. K. REDDY, Department of Energy Joint Genome Institute; CHRIS DAUM, Department of Energy Joint Genome Institute; ALEX COPELAND, Department of Energy Joint Genome Institute; I.-MIN A. CHEN, Department of Energy Joint Genome Institute; NATALIA N. IVANOVA, Department of Energy Joint Genome Institute; NIKOS C. KYRPIDES, Department of Energy Joint Genome Institute; CHRISTA PENNACCHIO, Department of Energy Joint Genome Institute; EMILEY A. ELOE-FADROSH, Department of Energy Joint Genome Institute; PAULO ARRUDA, Unicamp; RAFAEL SILVA OLIVEIRA, Unicamp, University of Western Australia. |
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Título: |
Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Data, v. 6, p. 1-11, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41597-019-0141-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article number: 140. |
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Conteúdo: |
The rocky, seasonally-dry and nutrient-impoverished soils of the Brazilian campos rupestres impose severe growth-limiting conditions on plants. Species of a dominant plant family, Velloziaceae, are highly specialized to low-nutrient conditions and seasonal water availability of this environment, where phosphorus (P) is the key limiting nutrient. Despite plant-microbe associations playing critical roles in stressful ecosystems, the contribution of these interactions in the campos rupestres remains poorly studied. Here we present the first microbiome data of Velloziaceae spp. thriving in contrasting substrates of campos rupestres. We assessed the microbiomes of Vellozia epidendroides, which occupies shallow patches of soil, and Barbacenia macrantha, growing on exposed rocks. The prokaryotic and fungal profiles were assessed by rRNA barcode sequencing of epiphytic and endophytic compartments of roots, stems, leaves and surrounding soil/rocks. We also generated root and substrate (rock/soil)-associated metagenomes of each plant species. We foresee that these data will contribute to decipher how the microbiome contributes to plant functioning in the campos rupestres, and to unravel new strategies for improved crop productivity in stressful environments. |
|
Palavras-Chave: |
Campos rupestres brasileiros; Condições extremas; DNA sequencing; Microbioma de plantas; Sequenciamento genético; Soils; Solos; Stressful environments. |
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Thesagro: |
Microrganismo. |
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Thesaurus NAL: |
Microbiome; Microorganisms; Velloziaceae. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/200538/1/AP-Microbiomes-Velloziaceae.pdf
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Marc: |
LEADER 02937naa a2200601 a 4500
001 2111238
005 2019-10-02
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
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100 1 $aCAMARGO, A. P.
245 $aMicrobiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot.$h[electronic resource]
260 $c2019
500 $aArticle number: 140.
520 $aThe rocky, seasonally-dry and nutrient-impoverished soils of the Brazilian campos rupestres impose severe growth-limiting conditions on plants. Species of a dominant plant family, Velloziaceae, are highly specialized to low-nutrient conditions and seasonal water availability of this environment, where phosphorus (P) is the key limiting nutrient. Despite plant-microbe associations playing critical roles in stressful ecosystems, the contribution of these interactions in the campos rupestres remains poorly studied. Here we present the first microbiome data of Velloziaceae spp. thriving in contrasting substrates of campos rupestres. We assessed the microbiomes of Vellozia epidendroides, which occupies shallow patches of soil, and Barbacenia macrantha, growing on exposed rocks. The prokaryotic and fungal profiles were assessed by rRNA barcode sequencing of epiphytic and endophytic compartments of roots, stems, leaves and surrounding soil/rocks. We also generated root and substrate (rock/soil)-associated metagenomes of each plant species. We foresee that these data will contribute to decipher how the microbiome contributes to plant functioning in the campos rupestres, and to unravel new strategies for improved crop productivity in stressful environments.
650 $aMicrobiome
650 $aMicroorganisms
650 $aVelloziaceae
650 $aMicrorganismo
653 $aCampos rupestres brasileiros
653 $aCondições extremas
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700 1 $aHUNTEMANN, M.
700 1 $aCLUM, A.
700 1 $aFOSTER, B.
700 1 $aFOSTER, B.
700 1 $aROUX, S.
700 1 $aPALANIAPPAN, K.
700 1 $aVARGHESE, N.
700 1 $aMUKHERJEE, S.
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700 1 $aDAUM, C.
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700 1 $aPENNACCHIO, C.
700 1 $aELOE-FADROSH, E. A.
700 1 $aARRUDA, P.
700 1 $aOLIVEIRA, R. S.
773 $tScientific Data$gv. 6, p. 1-11, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Volume |
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Fechar
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| Registros recuperados : 925 | |
| 41. |  | 1500039, AGRONOMIA COSTARRICENSE, Ministerio de Agricultura y Ganaderia.Colegio de Ingenieros Agronomicos, San Jose, CR
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Pantanal; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja. |   |
| 42. | | 4150010, AGRONOMIA LUSITANA, Estacao Agronomica Nacional/SACAVEM-Direccao Geral dos Servicos Agricolas, Oeiras, Portugal, PT
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Algodão; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Semiárido; Embrapa Trigo. | |
| 43. | | 5200006, AGRONOMIA TROPICAL, Fondo Nacional de Investigaciones Agropecuarias, Maracay, Venezuela, VE
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio-Norte... Mostrar Todas | |
| 44. | | 2000027, AGRONOMIE TROPICALE (PARIS), Institut de Recherches Agronomiques Tropicales et des Cultures Vivrieres, Paris, FR
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Hortaliças; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Solos; Embrapa Trigo. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados... Mostrar Todas | |
| 45. | | 5150111, AGRONOMY JOURNAL, American Society of Agronomy, Madison, Wis., US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Hortaliças; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Solos; Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão... Mostrar Todas | |
| 46. | | 0904706, AGROPECUÁRIA HOJE, Fundação de Estudos Agrários Luiz de Queiroz, Piracicaba, SP
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental. | |
| 47. | | 0901296, AGROPECUARIA TROPICAL, Agropecuaria Tropical Ltda., Recife, PE
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Hortaliças; Embrapa Instrumentação; Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Rondônia; Embrapa Roraima; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Solos; Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Tabuleiros Costeiros. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite... Mostrar Todas | |
| 49. | | 5150058, ALA BULLETIN, American Library Association, Chicago, Ill., US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Unidades Centrais. | |
| 50. | | 1850105, ALIMENTARIA (MADRID), Carlos Barros Ed Publ, Madrid, ES
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agroindústria de Alimentos. | |
| 51. | | 0905110, ALIMENTOS & TECNOLOGIA, Editora Alitec Ltda, Sao Paulo, SP
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Hortaliças; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. | |
| 52. | | 5150029, AMERICAN DAIRY REVIEW, Waltt Publishing, Mount Morris, Ill., US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Gado de Leite. | |
| 53. | | 5150446, AMERICAN ENTOMOLOGIST, Entomological Society of America, Lanham, MD, US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Algodão; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Uva e Vinho. MenosCatálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Algodão; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja... Mostrar Todas | |
| 54. | | 5150032, AMERICAN FERTILIZER, National Fertilizer Association, Willoughby, Ohio, US
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| 55. | | 5150034, AMERICAN FORESTS, American Forestry Association, Washington, US
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| 56. | | 5150038, AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, Botanical Society of America-New York Botanical Garden, Lancaster, Pa., US
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| 57. | | 5150039, AMERICAN JOURNAL OF CLINICAL NUTRITION, American Society of Clinical Nutrition, New York, US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. | |
| 58. | | 5150040, AMERICAN JOURNAL OF CLINICAL PATHOLOGY, American Society of Clinical Pathologists, Chicago, Ill., US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. | |
| 59. | | 5150041, AMERICAN JOURNAL OF ECONOMICS AND SOCIOLOGY, Robert Schalkenbach Foundation, New York, US
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais. | |
| Registros recuperados : 925 | |
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